İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi Araştırma Ekibi MareNostrum5 Süper Bilgisayarına Erişim Hakkı Kazandı

İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi’nden Araştırma Ekibi, MareNostrum5 Süper Bilgisayarına Erişim Hakkı Kazandı

Avrupa Yüksek Performanslı Hesaplama Ortaklık Girişimi (Euro HPC) çerçevesinde geliştirilen “MareNostrum5” adlı süper bilgisayara erişim hakkı kazanan İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi’nden araştırma ekibi, genetik hastalıklarla ilgili çözümler üretecek. Türkiye’nin 2019 yılından bu yana Euro HPC üyesi olmasıyla birlikte kurulan MareNostrum5, bilimsel atılımlara olanak sağlayacak kapasitelere sahip bir cihazdır.

Dünya sıralamasında 8. sırada yer alan MareNostrum5, yapay zeka, iklim değişikliği, yenilenebilir enerji ve sağlık bilimleri gibi farklı alanlarda bilim insanlarına ve endüstriye hizmet vermektedir. Bu süper bilgisayarın bilgi işlem kapasitesi 380 bin dizüstü bilgisayara eşdeğerdir ve bir dizüstü bilgisayarın 46 yılda yapacağı işlemi sadece 1 saatte gerçekleştirebilmektedir.

İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi’nde laboratuvarı bulunan İzmir Katip Çelebi Üniversitesi Biyofizik Ana Bilim Dalı’ndan Doktor Öğretim Üyesi Seyit Kale liderliğindeki araştırma ekibi, MareNostrum5’e erişim hakkı kazanan ilk Türk araştırmacılar olmuştur. Doktora öğrencisi Serhan Turunç ve araştırmacı Hatice Döşeme’nin de yer aldığı ekip, 1 yıl boyunca süper bilgisayarın gücünden faydalanarak nadir genetik hastalıklarla ilgili teşhis ve tedavi stratejileri geliştirmeyi hedeflemektedir.

Araştırmacılar, kazandıkları bilgi işlem süresini kullanarak genetik hastalıklarla ilgili kapsamlı analizler ve simülasyonlar gerçekleştirecekler. Özellikle rahman sendromu gibi nadir hastalıkların genetik araştırmalarına odaklanacak olan ekip, moleküler seviyede tanı oluşturarak tedavi yöntemlerine ışık tutmayı amaçlamaktadır.

“Bilgisayar ortamında hesaplamalı yöntemler kullanarak biyolojik moleküllerin hücre içinde nasıl davrandığını tespit ediyoruz. Hastalığa sebep olan mutasyonu taşıyan protein ile mutasyonu olmayan proteinin birbirleriyle olan dinamiğini inceliyoruz. Bu çalışma sonucunda farklılıklardan doğan ilişkileri çeşitli deneylerle de yorumlayarak genetik hastalıklar için moleküler seviyede tanı oluşturmaktayız ve bu sayede tedavi için terapötik yöntemlere yön vermiş oluyoruz.”

İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi’ndeki araştırmacılar, MareNostrum5 süper bilgisayarının sunduğu imkanlarla genetik hastalıkların moleküler seviyede anlaşılmasına katkı sağlayarak kişiye özel tedavi yöntemlerinin geliştirilmesine öncülük etmektedir.

  • Serhan Turunç, MareNostrum5’e erişim hakkı kazanan çalışmanın, nadir hastalıklar arasında yer alan rahman sendromunun genetik araştırmalarını geliştirmeye odaklı olduğunu belirtti.
  • Seyit Kale, her hastalığın moleküler bir açıklamasının bulunduğunu ifade ederek, ekip olarak moleküler düzeyde hastalıkların anlaşılmasına odaklandıklarını vurguladı.
  • Hatice Döşeme, MareNostrum5 adlı süper bilgisayarın sunduğu imkanlardan faydalanmanın gururunu yaşadıklarını belirtti.